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ISSN: 2333-9721
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酶-配体复合物亲和性的计算

Keywords: 药物设计,酶-配体复合物,亲和性,基于结构的定量构效关系

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Abstract:

描述了一种新的计算酶-配体复合物亲和性的方法.它考虑了酶-配体结合过程中自由能变化的各主要因素,并利用经验公式加以计算.从蛋白质结构数据库中选取了66个酶-配体复合物作为训练集,利用回归分析得出最后的模型.此模型通用于各种类型的酶-配体复合物,计算结果比较准确,预测算合物解离常数的平均偏差小于一个数量级.此方法还可以定量评价配体分子中每个部分对结合过程的贡献大小,可以为先导他合物的优化提供非常直接的信息.

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