ω-芋螺毒素的定量构效关系与虚拟筛选

ω-芋螺毒素属于海洋生物活性多肽,由24-31个氨基酸残基组成.特异性作用于电压敏感的钙离子通道(vgccs),能够直接开发成药物或作为先导化合物进行新药开发.本文应用新型氨基酸残基结构描述符cscales和遗传偏最小二乘算法,对ω-芋螺毒素进行定量构效关系(qsar)研究,并设计、构建了容量为2244个化合物的n-型和p/q-型vgcc拮抗剂虚拟组合多肽库,然后分别采用qsar模型预测和相似性搜索方法对组合多肽库进行了虚拟筛选.研究结果表明,建立的n-型和p/q-型vgcc拮抗剂qsar模型均具有较好的预测能力,交叉验证相关系数(cv-r2)均大于0.89.主成分分析和聚类分析结果表明,虚拟组合多肽库中化合物具有较好的结构多样性和差异性.通过虚拟筛选,得到了具有高预测活性的6个n-型和19个p/q-型钙离子通道拮抗剂,为进一步的合成和活性评价奠定了理论基础.同时,本文建立的多肽qsar预测模型和虚拟筛选策略,为其它多肽类化合物的定量构效关系研究和虚拟筛选提供了参考.