a1腺苷受体的同源模建及其结构验证

采用同源模建的方法构建了a1腺苷受体的三维结构,并与拮抗剂分子dpcpx对接,将得到的复合物结构进行5ns的分子动力学模拟,以最后2ns的平均结构和平衡后抽取的11帧构象共12个蛋白结构为研究对象,用包含52个活性分子和1000个诱饵分子的测试库,分别通过dock、vina和gold三种对接软件进行评价,最终得出合理的蛋白质模型.根据top10%的富集因子(ef)和roc曲线下面积(au-roc)的计算结果,我们认为gold是最适合a1腺苷受体的对接软件,而12个蛋白质结构中f5和favg的三维结构模型比较合理,可以作为进一步大规模虚拟筛选的模型.