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ISSN: 2333-9721
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鸟嘌呤四链体中na+的移动

Keywords: g-四链体,na+-g-四平面,abeemσπ/mm方法,从头算,移动路线

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Abstract:

na+-g-四链体复合物是一个明显的极化体系,其形成或解离过程中,na+的移动路线目前还不十分明确.σπ水平的原子-键电负性均衡方法融合进分子力学(abeemσπ/mm)模型除原子位点外,还明确地定义了孤对电子、σ键和π键的位置,并且各位点电荷随分子环境改变而浮动,因此能更好地反映该体系的极化现象.本文应用abeemσπ/mm方法研究了na+-g-四平面复合物的性质,包括它的几何构型、电荷分布和结合能等,并在mp2/6-31g(d,p)水平上做了相应的从头算,两种结果十分吻合.na+的存在改变了g-tetrad的氢键方式.通过比较na+各条移动路线中体系的结合能,预测g-四链体中三个na+最有可能沿α方向依次移出.以上研究为进一步应用abeemσπ/mm模型进行g-四链体中离子交换通道的动力学模拟打下坚实的基础.

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