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物理化学学报 2011
咪唑甘油磷酸酯脱水酶与含氮杂环磷酸酯类抑制剂作用方式的分子模拟Keywords: 咪唑甘油磷酸酯脱水酶,抑制剂,分子对接,力学优化,密度泛函理论,前线轨道 Abstract: 国际上依据咪唑甘油磷酸酯脱水酶(igpd)底物结构筛选,成功获得了一系列含氮杂环磷酸酯类化合物作为igpd抑制剂,然而igpd与含氮杂环磷酸酯类抑制剂间的作用模式尚不清楚.本研究利用gaussian03程序,基于密度泛函理论b3lyp方法,选择6-31g**基组优化含氮杂环磷酸酯类化合物,在确定其稳定构象的基础上利用分子对接、力学优化构建igpd与其含氮杂环磷酸酯类抑制剂相互作用的复合物结构,基于化合物的电子结构(前线轨道能级及组成、原子电荷、自然键轨道等)、复合物的空间结构(抑制剂识别igpd的功能域、分子间氢键、vanderwaals相互作用等)探讨了igpd与含氮杂环磷酸酯类抑制剂作用方式,确定了含氮杂环电荷分布、磷酸根离子电荷分布、前线轨道lumo能级是影响抑制剂活性的内在因素,为进一步筛选、优化高效的新型除草剂提供了重要信息.
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