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ISSN: 2333-9721
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水环境对gc和at碱基对质子转移的影响

Keywords: 密度泛函理论,碱基对,质子转移,第一水化层,连续化的水溶剂作用

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Abstract:

采用b3lyp/dzp++的方法研究了第一水化层作用和连续化处理的水溶剂作用对鸟嘌呤-胞嘧啶(gc)碱基对和腺嘌呤-胸腺嘧啶(at)碱基对质子转移反应的影响.gc和at碱基对在连续化水溶剂作用下,均发生单质子转移(spt1)和分步的双质子转移(dpt),而在第一水化层5个水分子的作用下(gc·5h2o,at·5h2o)或同时考虑第一水化层作用和连续化水溶剂作用(gc·5h2o+pcm,at·5h2o+pcm)时,gc和at碱基对的质子转移均只得到单质子转移反应(spt1).单质子转移过程中的活化能变化情况表明:第一水化层对gc和at碱基对结构和质子转移影响较大,水环境对碱基对的作用主要发生在第一水化层.

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