鸡8个功能基因5′-侧翼区与内含子的snp多样性比较

？本研究旨在探讨鸡功能基因5′-侧翼区的单核苷酸多态性(snp)水平。作者以白来航鸡、隐性白洛克鸡、杏花鸡、丝羽乌骨鸡、固始鸡、红色原鸡为材料,扩增了gh、ddbc1、riken、rasgrp3、igf1、thrsp、vip及prl共8个基因的5′-侧翼区dna序列。扩增序列全长为8,399bp,snp的总数为161个,平均每52bp出现一个snp。8个功能基因5′-侧翼区核苷酸多样性的θ均值和π均值分别为0.00620±0.00110和0.00559±0.00100。比较检验表明,5′-侧翼区的snp多样性显著低于内含子区域。5′-侧翼区是基因表达的一个重要调控区域,在分子进化和系统发生过程中承受着比内含子区域更大的选择压,其较低的snp多样性是适应性较好的表现。tajima检验与fu和li检验表明,与鸡繁殖性状显著关联的vip基因和prl基因很可能是人工选择或自然选择的目的基因。