鸭瘟病毒ul28基因的克隆、鉴定及序列分析

？摘要对已构建的鸭瘟病毒(dpv)dna基因文库重组质粒序列测序后，结合orffinder和blast工具分析得到了dpvul28基因的开放阅读框。pcr扩增后将其连接至pmd18-t克隆载体，获得完整基因。经测序、pcr和双酶切鉴定，进一步用核酸探针斑点杂交确认完整片段(orf2412)属于dpvdna(genbank登录号ef643557)。运用生物信息学分析软件nnppversion2.2、translatetool、dnastar等分析序列特性，并用emboss软件包的chips和cusp程序分析密码子使用情况。结果显示，其具有疱疹病毒_ul28类似家族成员的典型特征，包含1个保守结构域：疱疹病毒加工和组装蛋白(prtp)，并含有多个与功能相关的磷酸化和n-糖基化位点，编码多肽疏水区大于亲水区，是一种膜外蛋白。dpvul28基因与禽类疱疹病毒(α-疱疹病毒)的亲缘关系最近。ul28基因在密码子选择使用上显示出较强的偏爱性。