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农业生物技术学报 2007
dig和碱性磷酸酶标记cdna探针检测番木瓜prsv的比较Keywords: 番木瓜环斑病毒(prsv),地高辛(dig)标记探针,碱性磷酸酶直接标记,斑点杂交,印迹杂交,rt-pcr Abstract: ?利用地高辛(dig)标记和碱性磷酸酶直接标记的cdna探针核酸分子杂交及rt-pcr方法对番木瓜环斑病毒(prsv)进行了检测。根据genebank发表的prsv中国sm株系的外壳蛋白基因序列,设计特异引物,以美中红(caricapapayal.cv.meizhonghong)带病样品的rna为模板进行rt-pcr扩增反应,将其目的cdna片段克隆到pgem-teasy质粒载体上,并测序。以重组质粒作模板,用pcr-dig标记方法制备cdna探针,另一种非放射性探针是经凝胶电泳分离、纯化cdna片段,用碱性磷酸酶直接进行标记。结果表明,(1)美中红no.2序列与中国优势株系sm的同源性为94.7%;(2)dig标记的三种cdna探针(861bp,455bp和215bp)对样品的总rna检测结果是一致的,且861bp的探针杂交斑点最为清晰,上述核酸杂交结果与rt-pcr检测结果相符,核酸分子杂交检测的灵敏度和特异性能满足常规检测的需要;(3)碱性磷酸酶直接标记861bp的cdna探针可进行prsv的斑点杂交检测,而455bp的cdna片段用碱性磷酸酶直接标记时,不能获得有效的杂交结果;(4)本试验还用dig标记探针对叶脉进行了印迹杂交检测,结果与rt-pcr检测结果相符。
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