西农萨能羊47kd尾部相互作用蛋白基因(tip47)的cdna克隆、序列结构分析与组织表达

？47kd尾部相互作用蛋白基因(tail-interactingprotein47,tip47)是影响脂滴形成和代谢的重要基因。本实验以西农萨能羊(caprahircus)的乳腺组织为研究材料，采用rt-pcr和race，克隆了山羊tip47基因的cdna全长序列。结果得到tip47基因cdna序列全长1906bp(genbank收录号为：hq846827),包括5'utr82bp，完整编码区1314bp及3'utr510bp，编码蛋白质的氨基酸数为437，分子量47.36kd，等电点(pi)5.14。对tip47基因的核苷酸和氨基酸序列分析发现，山羊的tip47与genbank中牛(bostaurus)、人(homosapiens)、小鼠(musmusculus)和猪(susscrofa)的tip47相似性较高。蛋白质结构分析显示，tip47不存在信号肽序列和跨膜结构；疏水性分析发现，其n端疏水性较强，中间靠近c端部分亲水性较强；三级结构分析发现，其c端呈大写的l形；该基因的遗传距离分析发现，山羊与牛的亲缘关系最近，其次是猪和人。通过rt-qpcr技术对tip47基因进行了组织表达分析，发现所检测的12个组织中均有tip47mrna的表达，其中乳腺组织中表达最丰富，且远远高于其它组织，脾脏、肺脏次之，肌肉相对最少。研究结果提示，tip47基因可能在乳腺组织中对脂滴的形成代谢过程有重要作用。