基因芯片技术鉴定棉铃虫胁迫后棉花差异表达基因

？棉花在受到植食性昆虫为害后基因表达会发生变化，筛选鉴定这些调控基因有助于解析昆虫诱导棉花抗虫性的分子机制。本研究以棉花(gossypiumspp.)(中12)为实验材料，分别从正常生长条件下的棉花(对照)和棉铃虫(helicoverpaarmigerahübner)取食胁迫6、12、24和48h的棉花叶片(处理)中提取总rna，采用affymetrix棉花基因芯片进行了基因表达谱分析。结果表明，棉铃虫取食6h时，差异表达基因共有4109个(占28%)，其中上调1917个，下调2192个；棉铃虫取食12h时，差异表达基因共有2605个(占18%)，其中上调1326个，下调1279个；棉铃虫取食24h时，差异表达基因共有3213个(占22%)，其中上调1424个，下调1789个；棉铃虫取食48h时，差异表达基因共有2763个(占19%)，其中上调1450个，下调1313个。进行生物信息学分析后发现，这些基因功能涉及氧化应激响应、防御响应、信号转导、转录调控、黄酮类生物合成、萜类化合物合成与代谢以及源于多种氨基酸的罗勒生物碱生物合成等多个方面。另外，从芯片结果中鉴定获得调控棉花特异性挥发物的相关基因，发现法呢基焦磷酸合酶基因的表达量受昼夜节律的影响，同时，棉铃虫取食棉花诱导杜松萜烯合酶基因表达量上调。实时荧光定量pcr检测发现，棉铃虫取食6h的棉株中法呢基焦磷酸合酶基因和查尔酮异构酶基因表达量较高，而在被棉铃虫取食48h的棉株中这两个基因的表达量较低。研究结果为棉花受棉铃虫为害后产生的防御机制的研究提供了基础资料，进一步为植食性昆虫取食诱导植物产生萜烯类化合物提供了依据。