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农业生物技术学报 2007
鸭mhci轻链cdna克隆及其蛋白的二级结构, PP. 0-0 Abstract: ?为了阐明鸭主要组织相容性复合体i结构并推进其功能研究,本文采用fullracepcr法从其淋巴细胞cdna文库中克隆了鸭mhci轻链(b2m)cdna.随后,在pmal-p2x/e.colitb1原核表达系中可溶性表达了其成熟肽蛋白基因,并进行了纯化、蛋白酶切和westernblot鉴定.最后,测定了融合蛋白和mbp单体的圆二色谱(cd)值.鸭b2mcdna长792bp,包含18bp5’端和414bp3’端非翻译区.其orf为119个氨基酸(aa),包含20个aa信号肽和99aa成熟肽。成熟肽序列的第25位和80位为半胱氨酸(c),第80位半胱氨酸附近序列为“ytcrvdh”,与免疫球蛋白超基因家族的特征基序“f/ycxv/axh”相符.氨基酸序列与鸡、鱼、蛙、人和鼠β2m比较,同源性在30.3%-65.9%之间.cd测定结果表明鸭b2mα螺旋、β折叠、转角、随机卷曲分别为0aa、50aa、23aa和26aa,呈典型的β折叠。同源模建也显示鸭b2m三级结构(3d)由7个β片层折叠而成,不含α螺旋,这与cd测定结果相符合,并与人和小鼠b2m3d结构相似.
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