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农业生物技术学报 2014
金龙胆草查尔酮合酶基因(chs)的克隆及其在花期不同组织的表达量分析, PP. 661-671 Keywords: 金龙胆草,查尔酮合酶(chs),克隆,生物信息学分析,表达量分析 Abstract: ?查尔酮合酶(chalconesynthase,chs)是植物类黄酮化合物合成的第一关键酶。为了获得金龙胆草(conyzabliniilévl.)chs基因,本研究采用快速扩增cdna末端(rapid-amplificationofcdnaends,race)技术克隆得到了金龙胆草chs基因的dna和cdna全长序列,并进行生物信息学分析,通过rt-pcr检测该基因在花期不同组织部位中的表达情况并检测对应部位的相对花青素含量。结果表明,获得的chs基因dna全长2098bp,包括2个内含子;cdna全长为1692bp,含有完整开放阅读框(1197bp),编码399个氨基酸,包含查尔酮合酶的标志性序列,命名为cbchs(genbank登录号:kj155749)。序列比对结果显示,金龙胆草cbchs基因与已报道的其它植物的chs氨基酸序列具有很高相似性(最高为95%)。半定量rt-pcr结果显示,在叶和茎的表达量最高,相对表达量分别达到87.03%和98.33%,表达量之间没有显著差异(p>0.05);在根中cbchs基因表达量最少,相对表达量仅为9.43%,表达量与其余部位具有显著差异(p<0.05)。花青素含量也以茎和叶中最高,根中微量,表明cbchs基因与花青素的蓄积有一定相关性。本研究首次克隆了金龙胆草cbchs基因的全长dna及cdna序列,研究了其在花期不同组织器官中的表达量差异及与花青素的含量关系,为进一步研究cbchs基因对金龙胆草黄酮含量的影响及其调控机制提供了基础资料。
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