鸡脂肪性状重要候选基因的连锁不平衡模式分析

？对鸡脂肪性状候选基因进行连锁不平衡(linkagedisequilibrium,ld)分析可以为理解鸡体脂沉积的遗传学机制提供重要信息，并且可以提高脂肪性状相关分子遗传标记的检出效率。本研究以东北农业大学肉鸡高、低脂双向选择品系第8世代肉仔鸡为实验材料，通过直接测序、高效液相色谱(dhplc)、单链构象多态性(pcr-sscp)、限制性片段长度多态性(pcr-rflp)、长度多态性(pcr-lp)等方法对过氧化物酶增殖体激活受体(ppar-γ)、载脂蛋白b(apob)、解耦联蛋白(ucp)以及其他10个鸡脂肪性状重要候选基因进行多态性检测，计算候选基因标记间ld参数|d'|与r2，分析这些候选基因标记间的ld模式并探讨其规律。初步发现了以下特征：1、在各候选基因内，标记间的|d'|与r2值并不匹配，取值区间差异很大，|d'|值普遍大于r2；另外，在有些基因内的相同标记间，|d'|、r2值相差很大，甚至在|d'|=1时，r2接近于0。2、在不同基因甚至在同一基因内不同区域ld水平差异很大且物理距离与ld关系并不成线性关系。3、在有些基因内，如apob基因，相间位点间的|d'|和r2值大于相邻位点间的值。4、有些基因，如ppar-γ，相同标记间ld水平在高、低脂系间存在很大差异。本研究结果提示，在群体遗传学研究中进行候选基因ld分析时，ld参数r2的应用价值比|d'|更大。