主养草鱼池塘三种混养模式下鱼类肠道菌群pcr-dgge比较

？消化道微生物在宿主生长、营养和健康等方面起到重要的作用。本实验采用基于pcr扩增的变性梯度凝胶电泳(pcr-dgge)技术比较研究了主养草鱼(ctenopharyngodonidellus)池塘三种不同混养模式下的鱼类肠道菌群差异。结果表明，三种混养模式下同种鱼的生长率出现显著性差异(p<0.05)，而肠道细菌16srdnav3区特征片段pcr-dgge指纹分析显示草鱼的肠道菌群相似性较高(>42.2%)；投喂配合饲料的草鱼与摄食浮游生物的鲢(hypophthalmichthysmolitrix)、鳙(aristichthysnobilis)和匙吻鲟(polyodonspathula)肠道菌群结构相差最大(<19%)，鲢和鳙肠道菌群相似性较高(>41.6%)，除模式ⅱ鳙的肠道和匙吻鲟的胃菌群具有较高的相似性(>50.3%)外，匙吻鲟的消化道菌群和鲢鳙的相似性低。实验共回收测序了14条特定dgge条带中的dna片段，并进行系统进化分析，结果显示，这14条条带分别归属于4个细菌类群：变形细菌门(proteobacteria)，拟杆菌门(bacteroidetes)，厚壁菌门(firmicutes)和梭杆菌门(fusobacteria)。研究结果为鱼类混养模式的优化，饲料研发和鱼病防治提供了基础参考资料。