草鱼羧肽酶a1基因(cpa1)部分片段的单核苷酸多态性(snp)多态性及其与生长性状的关联分析

？羧肽酶a(ec3.4.16)是一类水解蛋白和多肽底物c端芳香族氨基酸或脂肪族氨基酸残基的消化酶。在草鱼生长相关的功能基因上研究单核苷酸多态性(snp)与生长的相关性可为草鱼的分子辅助育种提供依据。本研究根据草鱼(ctenopharyngodonidella)est-snp库的羧肽酶a1基因(cpa1)重叠群的2个contig扩增该基因的序列片段，采用直接测序法，经过序列比对，共筛到2个颠换snp位点：c+412a和a36c，分别位于cpa1基因外显子5的34bp和内含子3的36bp处，前者为错义突变。然后用一个群体的296尾草鱼对这2个位点用snapshot的方法进行检测和分型，统计基因型频率：a36c位点的aa基因型占26.7%，ac基因型占52.0%，cc基因型占21.3%。c+412a位点的aa基因型占15.5%，ac基因型占40.5%，cc基因型占43.9%。利用一般线性模型分析2个snp位点与草鱼体质量、体长等重要生长性状的关系。关联分析结果显示，c+36a位点不同基因型在体质量、眼间距均值上存在显著差异(p<0.05)。并且aa基因型和cc基因型在体质量、体长、体宽和眼间距上存在显著差异(p<0.05)。aa基因型各项指标均值显著高于cc基因型。c+412a位点在体质量等生长性状上差异不显著(p>0.05)，该位点和生长不相关，但是cc基因型和ac基因型在体重和肛前距上差异显著(p<0.05)，该位点cc基因型的6个生长性状均值都高于aa基因型。由两个位点组成的5种双倍型在体质量上存在显著差异(p<0.05)。双倍型d3和d5在体质量上存在差异显著(p<0.05)。双倍型d3和d8在体质量、体宽、体长、体长/头长等生长性状上都存在显著差异(p<0.05)。d3的各项指标均值最高，d8的各项指标均值最低。本研究结果显示，可以考虑将草鱼cpa1基因作为候选基因，用于草鱼的分子辅助育种。