番茄热激转录因子(hsf)基因家族鉴定及表达分析

？热激转录因子(heatshocktranscriptionfactor,hsf)已经被证实是广泛地存在于植物细胞内的一类重要的转录调节基因，对植物抵抗高温逆境伤害和其他生命活动具有重要作用。本研究利用番茄(lycopersiconesculentum)全基因组测序结果，鉴定番茄hsf家族成员；通过生物信息学方法，分析其系统发育关系和染色体定位；利用已有的番茄芯片数据和qrt-pcr进行组织表达谱和基因表达响应分析。结果表明，番茄基因组含有25个hsf基因家族成员，序列比对揭示其均具有转录因子特有的dna结合域(dnabindingdomain,dbd)；根据拟南芥(arabidopsisthaliana)、水稻(oryzasativa)和黄瓜(cucumissativusl.)hsf的基因结构和系统发育树将这些转录因子分为3个分支(a、b和c)，细分为15个亚分支(a1~a9、b1~b4以及c1~c2)。染色体定位结果表明，25个hsf基因除chr.1和chr.5外，其余不均匀分布在剩余10条染色体上。各个发育阶段表达谱分析表明，hsf基因具有不同的表达模式，近一半的基因处于高表达水平。qrt-pcr分析表明，大多数hsf家族成员参与番茄苗期应对高温热激反应。研究结果为揭示番茄hsf基因的功能提供基础资料。