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农业生物技术学报 2011
香鱼抗凝血酶基因(at)cdna的克隆、序列分析及组织表达特征, PP. 69-76 Keywords: 抗凝血酶,克隆,序列分析,组织表达特征,实时荧光定量pcr Abstract: ?抗凝血酶(antithrombin,at)主要抑制凝血酶(thrombin)及其它凝血因子的活性,并具有重要的抗炎活性。本实验从香鱼(plecoglossusaltivelis)肝组织cdna文库中成功获得了香鱼at基因的cdna全序列(embl登录号:fn429980)。测序结果表明,香鱼at基因cdna全长1487个核苷酸,包含1个大的开放阅读框(orf),推测编码1个由453个氨基酸组成的蛋白,n端23个氨基酸为信号肽序列。成熟at具有与哺乳动物at相似的特征结构,包括:羧基末端附近的丝氨酸蛋白酶活性中心、6个保守的cys残基形成的3个二硫键结构和4个n-糖基化位点。氨基酸序列分析表明,香鱼at与大西洋鲑(salmosalar)at氨基酸序列同源性最高,为81%。系统进化树分析表明,物种at的进化关系与目前接受的物种分类关系基本一致,香鱼at位于鱼类at簇中,与大西洋鲑、红鳍东方豚(takifugurubripes)和斑马鱼(daniorerio)at进化相关性最高。atmrna在健康香鱼的肝组织中表达量最大,在脾、肾和脑中表达量较低。实时荧光定量pcr结果表明,在鳗利斯顿氏菌(listonellaanguillarum)侵染4和8h的香鱼肝组织中atmrna表达量显著下调(p<0.05),但随着病程发展,12~36h,atmrna表达水平显著上调(p<0.05),揭示at是一个病程相关蛋白,并参与香鱼细菌感染导致的急性期反应。
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