玉米自交系产量和品质相关性状与简单重复序列(ssr)的关联分析

？为寻找并确定控制玉米产量、品质的基因组区域，本研究利用64对核心ssr(simplesequencerepeats)标记对257份玉米(zeamaysl.)自交系构成的群体进行基因分型，分析群体连锁不平衡位点、群体结构，在此基础上，采用tassel软件的glm(generallinearmode)程序对株高、穗位、生育期、穗长、穗行数、百粒重、脂肪含量、蛋白质含量和淀粉含量共9个性状的表型数据与标记进行回归分析，确定标记对表型的解释率。结果表明：(1)在公共图谱上的ssr位点组合都有一定程度连锁不平衡(linkagedisequilibrium，ld)，p<0.01时，ld成对位点占总位点组合20.29%，d'>0.5成对位点比例为12.65%。(2)ssr数据遗传结构分析表明，群体可分为5个亚群。(3)共鉴定出26个标记位点与9个性状相关联，大多集中在4、6、7和10染色体上，其中第7染色体上标记最多，为5个。8个位点的变异分别与株高、穗位、生育期、穗长、穗行数和蛋白质含量等6个表型性状极显著相关(p<0.01)，分别为umc1294作用于株高，对表型的解释率为7.2%；umc1741及phi116作用于穗位，对表型的解释率为11.37%和8.57%；phi328175及phi260485作用于生育期，对表型的解释率为4.74%和5.6%；umc1741作用于穗长，对表型的解释率为5.77%；umc1309作用于穗行数，对表型的解释率为6.68%；bnlg1450及bnlg1185作用于蛋白质含量，对表型的解释率为9.41%和9.81%；其他18个标记与9个性状显著相关(p<0.05)。与单个性状关联的标记数目为1~7个，解释率为4.74%~14.31%。与产量相关性状关联的位点(次)累计为30个，与品质相关性状关联的位点(次)累计为7个，位点数目上品质性状远少于产量性状。部分标记与多个性状关联，可能是性状相关或一因多效的遗传基础，一些标记同时与某性状关联，多数标记与定位于遗传图谱的qtl(quantitativetraitloci)一致，也有互补性。研究结果表明，这些位点及其区域内存在很多与产量、品质等性状相关的qtl，对提高玉米产量、改善玉米品质可能起到重要作用。