利用dna池和测序技术快速筛查候选效应单倍型

？选取产蛋性能具有明显差异的4个鸡品种（莱航鸡、阳山鸡、丝羽乌骨鸡和隐性白洛克鸡）构建品种dna池，通过测序研究鸡催乳素基因5′-侧翼调控区部分序列（1028bp）的单倍型，快速筛查到由4个多态位点（c-2402t、c-2161g、c-2062g和g-2040a）组成的2种最常见单倍型cccg和tgga，其中cccg在莱航鸡品种中的频率接近1，可能利于产蛋。再利用rflp和sscp将这4个位点在品种及家系中进行基因分型，基因分型之后的统计结果与测序的结果基本相符。利用农大褐×泰和丝羽乌骨鸡家系检测cccg单倍型的效应，发现含有此单倍型的单倍型组合具有更高的产蛋量。由6个位点组成的单倍型h3（cctctg，由cccg再加上t-2101和t-2054组成）在莱航鸡的频率为1，在参考家系中检测h3的效应，发现含有h3的单倍型组合具有很高的产蛋量，并且与其它类型达到显著性差异。从本研究可见，利用这种方法能有效筛查到可能的效应单倍型。