根癌农杆菌ti和at质粒基因组中的分泌型信号肽分析

？利用signalp3.0和predisi软件结合l值和tmhmm筛选，对根癌农杆菌(agrobacteriumtumefaciens)c58cereon菌株的ti和at质粒所编码的745个orf编码蛋白中的信号肽进行了预测，发现35条为分泌型蛋白，其中6条属于rr-motif型信号肽，2条蛋白的信号肽为细菌素-信息素型信号肽，新注释了24条分泌型信号肽，其中1条来自ti质粒，23条来自at质粒的蛋白。这些信号肽n结构域的长度变化为2~19aa,平均为6.8aa，h结构域的长度变化为8~34aa，平均为17.1aa。