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农业生物技术学报 2014
大口黑鲈高密度脂蛋白结合蛋白基因(hbp)snps的筛选及与生长性状关联性分析, PP. 168-176 Keywords: 大口黑鲈,单核苷酸多态性(snp),高密度脂蛋白结合蛋白基因(hbp),单倍型,双倍型 Abstract: ?高密度脂蛋白结合蛋白(highdensitylipoproteinbindingprotein,hbp)在动物的脂肪代谢中发挥重要的作用。脂类是鱼类的重要能源物质,尤其是那些对糖类利用率很低的肉食性鱼类。hbp基因的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,snp)可能会影响脂肪代谢,而对大口黑鲈的生长性状产生影响,研究其snp与生长性状的相关性可为其分子标记辅助选择提供候选标记。本研究根据大口黑鲈(micropterussalmoides)est-snp库中hbp基因的序列(genbankaccessionno.kf652241),用直接测序法在hbp基因3'非编码区获得了3个snps位点:h1(g+2782t),h2(t+2817c)和h3(g+2857a);随机选择同批繁殖、同塘养殖的165尾大口黑鲈样本,对3个snps位点用snapshot方法进行检测和分型,分型结果用软件popgene32进行遗传结构分析;运用软件spss17.0的一般线性模型(generallinearmodel,glm)对获得的不同基因型与生长性状进行关联分析。结果表明,3个位点均处于哈温平衡,其中h1和h2位点组成了两种单倍型(a和b),观测到3种基因型(aa、ab和bb);h1、h2和h3共组成6种双倍型(d1、d2、d3、d4、d5和d6)。不同基因型与生长性状的相关性分析显示,基因型bb在体质量和全长形态指标显著高于基因型ab(p<0.05),双倍型d6在体质量和全长形态指标显著高于双倍型d4(p<0.05)。本研究在大口黑鲈hbp基因3'非编码区获得了与生长性状相关的snps标记,可应用于大口黑鲈分子标记辅助选择育种。
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