马铃薯水通道蛋白基因cdna克隆、序列分析及蛋白质结构预测

？：以干旱胁迫处理的马铃薯（solariumtuberosuml.）普通栽培种“gannongshuno.2”叶片为材料，提取总rna，采用rt-pcr方法，扩增出一个编码288个氨基酸序列的水通道蛋白基因stpip1(solariumtuberosuml.plasmamembraneintrinsicproteingene)cdna，genbank登录号为dq999080，用生物软件对stpip1分析表明，stpip1含有6个跨膜区，具有mip家族的特征信号序列sgxhxnpavt，还具有质膜水通道蛋白家族的特征信号序列ggganxxxxgy和tgi/tnparsl/fgaai/vi/vf/yn。聚类分析表明和其他14个物种pip1类同源性在92％以上，应属于质膜水通道蛋白pip1类。用运同源建模的思想预测stpip1蛋白质三级结构，swiss-model反馈结果表明和菠菜(2b5f)水通道蛋白结构相似，单体由5个短环相连的6个亲水的跨膜螺旋，n末端、c末端以及b、d环位于细胞内，a环、c环及e环在细胞外，一般以四聚体的形式存在。