苹果superman类蛋白家族的基因克隆与生物信息学分析

？superman类基因是植物生长发育中的重要转录因子。为了揭示苹果superman类蛋白家族的生理基因功能，本研究以富士苹果(malusdomesticaborkh.cv.fuji)为试材，利用rt-pcr方法和锚定pcr方法克隆了mdlifa(genbank登录号hm370493)和启动子序列，利用特异引物pcr方法克隆了苹果基因组中其余11个superman类基因。12个基因命名为mdlifa/mdlifb(genbank登录号：hq260429)、mdsup1a(hq418477)/mdsup1b(hq418478)、mdsup4(hq418475)/mdsup12(hq418476)、mdsup5a(hq418469)/mdsup13b(hq418470)、mdsup9a(hq418473)/mdsup9b(hq418474)和mdsup5b(hq418471)/mdsup13a(hq418472)，分别位于11/3、1/1、4/12、5/13、9/未知和5/13号染色体，每对基因间的同源性均在86%以上。通过基因枪法轰击洋葱(alliumcepa)表皮细胞，基因瞬时表达证明mdlifa定位于细胞核内。mdlifa基因启动子序列中含有多个参与花粉发育、根特异性表达、与光诱导和dof单锌指基因家族作用的调控元件等。系统进化分析表明，mdlifa/b、mdsup9a/9b和mdsup5a/13b、以及mdsup1a/b、mdsup5b/mdsup13a和mdsup4/12分别聚类为一组，参与植株的形态建成和花器官发育。苹果12个superman类基因成对高度同源，具有生物学功能的多样性，为深入的基因鉴定和遗传转化提供有用信息