六种甘蓝自交不亲和雄性决定因子部分cdna的克隆及序列分析

？s-富含半胱氨酸蛋白(scr)是自交不亲和雄性决定因子，为了比较甘蓝不同s单倍型scr基因结构和蛋白分子特性，依据mrna的ploya序列和scr保守氨基酸序列设计引物，利用巢式pcr技术分别获得了6种甘蓝(brassicaoleraceal.)d3、e1、240、a1、n1和g1的scr基因的部分cdna序列，均包含3'utr。生物信息学分析表明，6条cdna序列长度分别为319、311、290、288、385和377bp，分别编码1个58、58、58、58、58和55个氨基酸的scr蛋白，其中d3的scr与scr3序列一致，甘蓝e1、240、a1和n1的scr与scr7序列一致，而甘蓝g1的scr为一个新的s单倍型基因。研究表明，不同s单倍型的scr二级结构和三维结构都有差异，其与s-位点受体激酶(srk)相互作用的氨基酸在scr分子表面，富含碱性氨基酸，且srk-scr相互作用需要静电荷参与。同时研究还表明，甘蓝自交不亲和性强度多样性，除了scr和srk本身作用能力因素以外，还与scr和srk分子的数量有关，而scr的数量是通过3'utr在mrna水平调控的。分析表明，scr的进化速度很快，并且3'utr的进化速度高于氨基酸编码区的进化速度。本研究为进一步探索和利用自交不亲和机制提供了理论基础