菊科brc1-like基因片段的克隆与进化分析

？菊科(asteraceae)植物在进化中产生了丰富的分枝类型，而分枝类型的多样性源于分枝相关基因的多样性。brc1(branched1)基因作为tcp家族的成员，已被验证具有抑制侧枝伸长的功能，且该家族的基因具有较快的进化速度。本文研究了brc1-like基因的进化模式，该基因在进化中多次复制，且不同成员受到不同的选择压，这些可能是该家族成员众多及功能多样性的基础。本研究以菊科16个种为材料，克隆得到21个brc1-like基因的片段，均包含保守的tcp结构域，r结构域，以及ece模体，属于tcp家族中的cycloidea1(cyc1)亚簇。结合ncbi中得到的非洲菊(gerberahybrid)和向日葵(helianthusannuus)的brc1-like基因序列，构建系统发育树，结果表明，cyc1亚簇在菊科中又分为两组，分别命名为brc1a和brc1b，表明此亚簇在形成后又进行了复制。利用最大似然分枝检验的方法，对其进化选择压进行检验，结果表明，brc1b受到了强烈的纯化选择，而brc1a受到的选择压减小。进一步运用最大似然分枝-位点检验的方法，证明brc1a受到中性选择，而未受正选择。利用最大似然位点检验的方法，检测了brc1-like基因片段受到纯化选择和中性选择的位点，结果表明纯化选择的位点主要集中在tcp和r结构域，以及ece模体，证明两组基因的主要结构域在进化中被固定。菊科植物中brc1-like基因片段的进化表明，该基因首先通过复制成为两组，而这两组受到了不同的选择压，可能会导致产生不同的功能。