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ISSN: 2333-9721
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郏县红牛跨膜蛋白18基因(tmem18)snps检测及其与生长性状的关联分析

, PP. 127-136

Keywords: ,tmem18基因,snp,生长性状

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Abstract:

?跨膜蛋白18基因(transmembraneprotein18,tmem18)在神经系统表达。全基因组关联分析(gwas)表明,该基因的突变会影响人类肥胖和bodymassindex(bmi)值变化。本研究采用dna池测序技术检测了郏县红牛(bostaurus)tmem18基因5个外显子和部分内含子区单核苷酸多态(singlenucleotidepolymorphism,snp)位点,通过pcr-rflp技术对所发现的snp位点进行分型验证,然后分析不同基因型与郏县红牛生长性状的关联性。结果表明,在郏县红牛tmem18基因上共发现了3处新的snps:nw_003099175.1:g.2303g>a、g.3835g>a和g.3865a>g(aa.gly>ser)。关联分析结果表明,郏县红牛tmem18基因g.2303g>a位点aa型个体体高、体长、胸围和体重显著大于gg型(p<0.05),郏县红牛tmem18基因g.3835g>a位点ag型个体胸围和体重显著大于aa型(p<0.05)。研究结果提示,这两个位点可作为郏县红牛品种体尺和体重生长性状选择的分子育种候选标记。

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