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农业生物技术学报 2010
甘薯茎线虫诱导抑制差减杂交cdna文库的构建及表达序列标签分析, PP. 52-60 Keywords: 甘薯,茎线虫,抑制差减杂交,表达序列标签,实时荧光定量pcr Abstract: ?以甘薯(ipomoeabatatas(l.)lam.)抗茎线虫病品种鲁薯3号为材料,利用抑制差减杂交(suppressionsubtractivehybridization,ssh)技术,构建了甘薯茎线虫诱导的甘薯块根cdna文库,从中筛选出1379个阳性克隆进行测序,用cap3软件聚类拼接,得到185个uniqueest。blast2go比对ests,并进行go功能分类,结果发现151条非重复序列与已知基因同源性很高,占全部非重复序列的81.6%。已知功能的est涉及植物的能量代谢、信号转导、抗病防卫、蛋白质合成等多方面。通过对已知功能的基因进行分析,推测促分裂原活化蛋白激酶、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、过氧化氢酶、几丁质酶、葡聚糖酶等可能参与甘薯接种茎线虫后相关的抗性反应。实时荧光定量pcr分析结果表明,与抗茎线虫病相关的4个基因在甘薯接种线虫后不同时间点具有不同的表达模式。
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