多聚半乳糖醛酸酶基因家族的分子进化研究*

？pg（polygalacturonase,pg）广泛存在于从低等到高等的各种生物中，目前数据库中已积累了大量的序列资料。为了进一步了解pg基因家族的分子进化，以及其作为系统进化研究材料的可能性，我们选取了88条来自不同物种包括细菌、真菌和植物的pg蛋白序列，用clustalw程序对其氨基酸序列进行了联配，并用邻位相接法构建了系统进化树。结果表明，尽管不同来源的pg序列表现了很大的差异，但仍有4个保守性极强的结构域存在（175ntd、197dd、218ghg、250rik）；同时发现在pg序列中大多数的cys位点均具有较好的保守性，而且在细菌、真菌和植物的pg序列中各有自身保守的cys位点，未发现在所有比对的序列中都保守的cys，cys的保守性体现了物种的分类关系；进一步构建分子进化树显示，pg基因基本上首先根据物种类型而聚类，明显地划分为细菌、真菌和植物三大类；其次，不同作用方式的endo-pg和exo-pg在各类群中都处于完全独立的分支中，表明pg随着物种的分类，功能上表现为趋异进化，功能上的趋异进化可能早于物种的分化。