鸡mir-1816前体区单核苷酸多态性(snp)与鸡经济性状关联分析

？micrornas(mirnas)前体区的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,snp)，可能会影响mirna的加工过程，导致成熟mirna产量的改变，进而发挥重要的生物学功能。为研究位于mir-1816前体区圆环上的单个snprs16057773(a＞g)的遗传效应，并探究该snp是否影响成熟mir-1816的生成，在固始鸡-安卡鸡(gallus)f2资源群中，对该snp与经济性状进行关联分析，该snp与不同周龄的体重及部分体尺性状包括胫围、体斜长和骨盆宽等性状存在显著相关(p＜0.05)，表明该snp在鸡生长发育过程中扮演重要角色。使用在线软件预测显示，该snp不影响mirna二级结构的稳定性。通过进一步构建mir-1816的2种基因型的pcdna3.1-egfp表达载体并转染鸡胚成纤维细胞df1，实时荧光定量pcr(quantitativereal-timepcr,qrt-pcr)检测显示，不同基因型重组质粒组间成熟mir-1816的表达量相似，表明该snp不影响mir-1816的加工过程。本研究揭示了位于mir-1816基因前体区上的snp与鸡的经济性状存在显著的相关性，但该snp并不影响mir-1816的加工过程，不改变成熟mir-1816的表达水平，说明该snp不是通过调控自身mirna的表达量而发挥重要的功能。该研究提示mirna前体区snp发挥功能存在不同的途径，有助于对mirna精细加工过程的理解。