猪α(1,2)岩藻糖转移酶基因(fut1)启动子区结构特征及多态性分析

？α-(1,2)岩藻糖转移酶基因1(fut1)是断奶仔猪f18大肠杆菌(escherichiacoli)抗性的重要候选基因。为探讨fut1基因启动子区的分子结构特征和重要的变异位点，本研究基于前期猪(susscrofa)fut1基因上游序列转录活性双荧光素酶报告基因的检测结果，对表现出启动子活性的fut1基因上游非编码区-1150~50bp区域cpg岛、启动子和转录因子结合位点等结构特征进行生物信息学分析，并利用聚合酶链式反应-单链构象多态(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphism,pcr-sscp)方法对该段序列在野猪和11个不同猪品种中的多态性进行分析。实验结果表明，fut1基因上游启动子区序列存在3个cpg岛(cpgislands)，分别位于-1104~-886bp、-796~-619bp和-316~-130bp；启动子和转录因子结合位点的特征分析显示，该序列存在特异性蛋白-1(specificityprotein1,sp1)、核转录因子-2(nucleartranscriptionfactor2,nrf-2)、e26特异性转录因子(e26transformation-specific,c-ets)和gata结合蛋白1(gata-bindingprotein1,gata-1)等转录因子结合位点；pcr-sscp结果显示，fut1基因的启动子区存在一个t(-726)c的突变位点，共检测到aa、ab和bb3种基因型，分型后计算出各群体的基因型和等位基因频率，分析结果显示，梅山、荣昌、小梅山aa基因型频率很低，而野猪以及二花脸、枫泾、淮猪、香猪等中国地方猪品种中仅检测到bb和ab基因型，未检测到aa基因型。本研究结果进一步证实，中国地方猪种和引进猪种f18大肠杆菌抗性的遗传基础存在明显差异，这种差异可能与fut1基因启动子区t(-726)c位点变异有关。研究结果为可稳定遗传的功能多态位点的筛选以及开展fut1基因的启动子区调控机理研究奠定基础。