尼罗罗非鱼生长激素促分泌素受体基因(ghsr)生长相关单核苷酸多态性(snps)位点的筛选

？本研究用直接测序法，以尼罗罗非鱼(oreochromisniloticus)基础群体和快长群体父母本为材料进行生长激素促分泌素受体基因(growthhormonesecretagoguereceptor,ghsr)单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymophisms,snps)位点的筛选；再以两群体的子代为材料，采用snapshot法对筛选到的snps进行基因分型，并利用一般线性模型(generallinearmodel,glm)对基因型与生长性状进行相关性分析。结果表明，从两个尼罗罗非鱼群体的ghsr基因中共获得s1(a-409g)、s2(g-424t)、s3(t-553a)、s4(t-1114a)和s5(a-1168c)等5个snps位点，且均分布于该基因5′侧翼区。snps基因型与尼罗罗非鱼子代生长指标关联性分析结果表明，当s4位点为aa或at基因型时，尼罗罗非鱼个体的体重、体长、体高、头长、尾柄长和尾柄高等生长指标均显著大于s4位点基因型为tt的个体(p＜0.05)，快长群体子代中s4位点at基因型频率最高(55%)，而在基础群体子代中tt基因型频率最高(75.94%)。5个snps位点不同基因型组成了7种双倍型(d1~7)，其中d3和d5双倍型个体的体重、体长、体高、头长、尾柄高等生长指标显著高于d4和d7双倍型个体(p＜0.05)；而d1(体宽除外)、d2(体宽和尾柄长除外)和d6(体高除外)双倍型个体与其他双倍型个体之间在生长指标上均无显著差异(p＞0.05)。快长群体子代和基础群体子代中的优势双倍型分别为d3双倍型(46.25%)和d4双倍型(35.44%)。因此，尼罗罗非鱼ghsr基因中s4位点处aa、at基因型及双倍型d3、d5与快长性状密切相关，可作为尼罗罗非鱼分子标记辅助育种的候选标记。