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农业生物技术学报 2015
利用目标起始密码子多态性(scot)分子标记分析梨遗传多样性, PP. 561-570 Keywords: 梨,目标起始密码子多态性(scot),遗传多样性,聚类分析 Abstract: ?目标起始密码子多态性(startcodontargetedpolymorphism,scot)是一种新型的遗传分子标记技术。本研究采用单因素水平设计方法,优化并建立梨的适宜scot分子标记体系,通过scot标记技术,分析了安徽省砀山县的43份梨(pyrusspp.)的遗传多样性和亲缘关系。结果表明,优化后梨scot-pcr反应体系:10×easytaqbuffer(含2mmol/lmg2+)2.5μl,模板dna终浓度30mg/l,上下游引物终浓度1.0μmol/l,dntps终浓度0.2mmol/l,taqdna聚合酶1.0u,总体积为25μl。随机选取2个dna模板进行引物筛选,最终从67条引物中筛选出16条扩增条带清晰且有差异性的引物,共扩增出145条带,其中多态性条带有126条,多态性比率为86.1%,每条引物平均扩增出9.1条带。scot标记的43个梨材料遗传相似性系数为0.517~0.931,平均值为0.685。聚类分析表明,在遗传相似系数为0.610的水平上,43份梨材料分为a和b两组;在遗传相似系数为0.746的水平上,a组又分为6个亚组(ⅰ~ⅵ)。所研究的43份梨材料具有丰富的遗传多样性,且能够被scot分子标记有效地检验,为进一步研究利用安徽省砀山县梨种质资源提供了依据。
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