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天津医药 2010
天津地区结核分枝杆菌可变串联重复序列多态性研究Keywords: 结核分枝杆菌,北京家族,串联重复序列,基因分型,分子流行病学 Abstract: ?目的分析天津地区流行结核分枝杆菌基因组中分布的可变串联重复序列(vntr)拷贝数目多态性,建立对不同mtb菌株(特别是在我国广泛流行的结核菌北京家族株)分辨能力强的vntr基因分型方法。方法使用22个vntr位点分析临床分离的102株结核分枝杆菌基因组拷贝数目,使用hunter-gaston分辨指数(h)评估各个vntr位点的多态性和vntr基因分型方法对菌株的综合辨别能力。结果本研究中确定的14个vntr位点对不同mtb菌株具有很强的分辨能力,其分辨指数指数达0.9963。在所分析的各个位点中,7个vntr位点qub11b,11a,18,26,miru-26,31,mtub21的多态性最好(h>0.3),7个位点qub1895,etr-a,miru-10,20,27,39,40对菌株的分辨能力较好(0.1
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