全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...
天津医药  2015 

高通量测序分析胆囊结石患者microrna表达谱差异

, PP. 348-352

Keywords: 微rnas,基因表达谱,序列分析,胆囊结石病,差异表达,高通量测序,生物信息学

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

?:目的探讨胆囊结石和非结石患者胆囊黏膜中mirna表达谱的差异。方法选取30例胆结石患者(结石组)和30例胆囊息肉患者(非结石组)的胆囊黏膜组织,采用illuminahiseq2500高通量测序技术进行深度测序,比较2组的microrna表达差异。对差异表达的mirnas进行筛选与靶基因预测,并进行go和kegg功能显著性富集分析。荧光定量rt-pcr(qrt-pcr)对差异表达mirnas进行验证。结果结石组和非结石组分别获得2215832和1424770条序列,平均长度22nt。2组间显著差异表达的mirna共计17个,其中9个表达上调,8个表达下调。go分析结果示靶基因富集于离子的结合和转运、载脂蛋白结合、钙离子通道激活、蛋白激酶活性等分子功能以及大分子的合成和代谢、类固醇激素生物合成和代谢等生物进程。kegg通路富集分析示靶基因多集中于癌症相关通路,包括wnt、hippo等信号通路。qrt-pcr结果示差异性mirna的表达趋势与测序结果相一致。结论差异表达的mirna可能在胆囊结石的形成中具有重要作用。

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133