羊驼kit基因exon10-19cdna的克隆、表达及生物信息学分析

？从羊驼皮肤中提取总rna，利用rt-pcr技术，扩增了羊驼显性白毛控制基因（kit）cdna序列（dq450844），并与其它动物相应区域作了同源性比较，结果表明：羊驼kit基因exon10-19cdna长1044bp，编码含347个氨基酸残基的蛋白；蛋白质同源性比较显示，羊驼与牛、羊、猪、人、马、猩猩等的同源性大于98%，与鼠的同源性为95%。羊驼aa2编码缬氨酸，而猪、人与牛等动物则编码异亮氨酸，均属于非极性氨基酸；羊驼aa201编码脯氨酸，是非极性氨基酸，而猪、人与牛等动物则编码丝氨酸，是不带电荷的极性氨基酸；羊驼aa344编码精氨酸，而猪、人与牛等动物则编码赖氨酸，均为带正电荷的极性氨基酸。蛋白质二级结构及功能分析结果显示：此二级结构中含有大量的α-螺旋；该蛋白编码肥大细胞/干细胞生长因子，属于酪氨酸激酶受体家族，其蛋白激酶活性位点位于248~260之间。本研究结果将为深入研究kit基因与羊驼毛色遗传的关系奠定一定的理论基础。