中国水禽新城疫病毒f和hn基因的变异趋势

？选取中国1996-2005年的8株鹅、鸭等水禽ndv流行株，克隆其融合蛋白（f）和血凝素－神经氨酸酶（hn）基因，参考genbank中具有f和hn核苷酸全长的16株国内外ndv代表株、16株国内水禽流行株以及12株只具有f基因的水禽毒株序列，参照传统f基因分型方法，分别对f和hn基因进行分型，同时进行相关比较、核苷酸和氨基酸同源性以及系统发育分析。结果表明：16株国内外代表株f和hn基因分型基本一致，但24株水禽ndv流行株中只有15株相同，符合率为62.5％，不同占37.5％（9/24）。系统发育和同源比较发现：水禽ndv流行株hn基因高度同源，同属ⅶ型，而f基因则分属不同的基因型。通过对24株ndvf和hn基因氨基酸全长以及进行f基因分型的f基因47-420位核苷酸的同源性相关性比较证实：f基因前47-420位核苷酸的遗传变异与f基因氨基酸全长变异密切相关，r＝0.916，但与hn基因的氨基酸变异不相关，显示出ndv在演变过程中f和hn基因具有相对的独立性。水禽ndv是家禽ndv的重要储存宿主，应高度重视水禽ndv的变异。