犬贾第虫病毒（长春株）全基因组序列分析

？根据已报道的人源蓝氏贾第虫病毒序列设计了互相重叠的6对特异性引物，以犬贾第虫（长春株）纯培养滋养体总核酸为模板进行rt-pcr。pcr产物连接到pmd18-t载体进行测序，通过blast在genbank进行同源性搜索，并用dnaman分子生物学软件进行分析。结果测得我国犬贾第虫病毒(长春株)基因组全长为6276bp(dq238861)，编码1个有887个氨基酸残基的衣壳蛋白和1056个氨基酸残基的融合蛋白，这2个阅读框被-1核糖体移码框分开，重叠处有220nt。基因组中g+c占49.62%。其序列与国外报道的人源蓝氏贾第虫病毒（l13218）序列同源性为94.62%，编码的氨基酸同源性为93.50%；与国内人源蓝氏贾第虫病毒（af525216）序列同源性为98.88%，编码的氨基酸同源性为98.30%。