猪mef2a基因的克隆与表达

？为了进一步了解猪mef2a基因的结构与功能，本研究采用生物信息学结合rtpcr的方法，克隆了猪的mef2a基因，获得了它的2个变异体序列。结果表明，猪mef2avariant1基因cdna长1524bp（ef576923），编码508个氨基酸，分子量为54.481ku；variant2基因cdna长1416bp（ef576922），编码471个氨基酸，分子量为50.846ku。mef2a两个变异体的氨基酸序列同源性为86.79%，第1aa~77aa和第132aa~470aa完全一致，第78aa~131aa是高变区，variant2与variant1相比，在第224aa~258aa处存在34个氨基酸（102bp）的缺失。利用realtimepcr方法检测了mef2a的表达。结果表明，mef2amrna是一个广谱表达基因，在心、肝、胃、脾、肾、肺、大肠、小肠、背肌和腿肌中都能检测到，在腿肌中优势表达。mef2avariant1与马和家鼠构成一个小类群，而variant2与牛和人构成了另外一个小类群，推测mef2a基因在进化过程中发生了较为明显的变异。