山羊肌肉组织micrornasolexa测序与生物信息学分析

？本研究旨在挖掘山羊肌肉组织mirna，获取山羊肌肉组织mirna表达谱并分析其生物学特征，为进一步研究特定mirna参与山羊肌肉细胞的增殖与分化等生长发育机制奠定理论基础。从山羊肌肉组织中提取总rna，分离、构建小片段rna文库，利用solexa方法进行测序并进行生物信息学分析，最后利用q-pcr技术验证mirna在山羊肌肉组织中的表达情况。共鉴定出517个物种间保守的和2个山羊基因组特有的mirna。其中306个表达量在100以上。随机选择8个mirna，利用q-pcr验证其在山羊肌肉组织中的表达情况，结果与测序结果一致。同时mirna靶基因预测和功能分析表明，很多mirna可能影响一些与动物肌肉发育相关的细胞信号通路。测序成功获取了山羊肌肉组织mirna序列及其表达谱，山羊肌肉组织mirna表达丰富且表达量各异。本研究也为进一步研究mirna调控哺乳动物肌肉发育奠定了理论基础。