h1n1猪流感广东株血凝素基因的克隆与序列分析

？用rt-pcr方法扩增h1n1亚型猪流感病毒广东分离株a/swine/guangdong/711/2001ha基因，对其进行了克隆和测序。结果显示，ha基因全长1771bp，共编码579个氨基酸。a/swine/guangdong/711/2001ha基因编码的氨基酸序列中有8个糖基化位点，5个位于ha1基因的第27、28、40、104和287位点，3个位于ha2基因的21、153和213位点。与h1n1亚型猪流感经典毒株比较后发现，血凝素糖基化位点并不是高度保守的。将a/swine/guangdong/711/2001与自genbank读取的1918年人流感毒株a/southcarolina/1/18、1991年人流感毒株a/md/12/91和1997年猪流感毒株a/swine/wisconsin/238/97等进行核苷酸同源性比较分析，a/swine/guangdong/711/2001与a/southcarolina/1/18、a/md/12/91和a/swine/wisconsin/238/97等毒株的核苷酸同源性分别为93.9%、94.7%和93.9%。从系统发生树来看，a/swine/guangdong/711/2001与a/southcarolina/1/18和a/swine/wisconsin/238/97的亲缘关系相近。