荷斯坦牛耐热性rapd和scar标记的研究

？以52头高产耐热组和41头高产不耐热组中国荷斯坦牛的dna为材料，选用200条rapd引物，利用rapd-pcr技术，对荷斯坦牛的耐热性进行研究。结果发现，使用s441引物和s463引物在高产耐热组中分别发现了581bp（rapd-s441标记）和680bp（rapd-s463标记）2条特异性片段。通过测序和序列比较显示：581bp的片段与kcnn2基因的同源性达90%；680bp片段与nw_001024067.1|btun_wga9442_2的同源性达99%。根据已知kcnn2基因的功能，初步判断kcnn2基因为影响耐热性能的候选基因。得到genbank登录号ef123743和ef123744。利用ncbi的orffinder在581bp中没有发现orf，与预测其是kcnn2基因内含子3的结论相符合。在680bp中发现4个开放阅读框（orf），分别为orf1、orf2、orf3、orf4。这4个阅读框分别编码48aa、34aa、45aa、34aa。根据rapd-s441、rapd-s463标记的测序结果，利用premier5.0软件设计对应的scar引物。成功将rapd-s441标记转化为耐热scar标记。