甘肃省猪香港病毒的巢式pcr检测及vp1基因序列的系统发育分析

？猪香港病毒（phov）于2008年在我国香港首次发现，属细小病毒新成员。本研究自甘肃省兰州、张掖、天水市养猪场和屠宰场采集血液样品147份，针对phov的vp1基因保守区(genbankno.eu200677)设计2对引物，用巢式pcr（npcr）检测phov。结果，甘肃省生猪phov总阳性率为38.10%(56/147)。其中，12周龄以上猪的阳性率(55.56%)显著高于6周龄以下猪（25.00%）（p<0.05）；三地区间的阳性率差异不显著（p>0.05）。从56份阳性样本中挑选具地域代表性的12份，对vp1扩增片段测序(genbank注册号：jq177084～jq177095)，并和genbank中的所有vp1序列一起进行系统发育分析。结果表明，12个vp1片段序列之间的相似性为95.2%～99.0%。其中，jq177093、jq177085和jq177089构成一个独立的分支；其余9株和来自genbank的12株参考序列均处于另一分支。9株中，jq177095、jq177087和jq177091构成一个亚分支，紧邻罗马尼亚野猪株（jf738366）；jq177086、jq177090和jq177094构成第二个亚分支，紧邻香港株hk3；jq177088、jq177092和jq177084构成第三个亚分支，紧邻香港株hk5。12株phov的vp1基因片段序列与香港株hk1～hk6的总体相似性为96.7%～99.7%，与罗马尼亚野猪株为95.2%～99.0%。本研究结果表明，源于罗马尼亚野猪株和香港株的phov均在甘肃省猪群中高水平流行。