不同尾型绵羊全基因组选择信号检测

？为研究不同尾型绵羊群体遗传分化程度，检测全基因组选择信号，以挖掘不同尾型绵羊重要性状相关的候选基因。本研究基于蒙古羊（短脂尾）和藏羊（瘦尾）群体的illuminaovinesnp50k芯片分型数据，借助遗传分化系数fst法进行群体间选择信号检测，寻找选择信号区域内的重要基因，并对其中与脂肪代谢相关的基因pparg、pdgfd在呼伦贝尔羊（大尾和小尾品系；肥尾）与藏羊（瘦尾）尾脂进行mrna相对表达量研究。结果，（1）465个snps被选择，基因注释找到448个候选基因，筛选到50个与脂类代谢相关的基因，go功能富集分析发现，主要富集在脂类生物合成过程、磷脂代谢、脂质结合等条目，此外发现4个基因（pparg、rxrg、slc27a2和acsl6）富集到ppar信号通路。（2）肥瘦尾之间，呼伦贝尔羊（大尾和小尾品系）pparg和pdgfd基因表达量均显著高于藏羊（p<0.01），而大小肥尾之间，呼伦贝尔羊大尾品系pparg基因表达量显著高于小尾品系（p<0.05），pdgfd基因表达量则无明显差异。通过fst法有效检测到受选择的基因，部分与绵羊重要性状相关，相对定量试验证明pparg和pdgfd基因与尾部脂肪沉积密切相关，可以作为尾型选育的候选基因，为绵羊育种及改良提供重要参考。