狐狸agouti基因snps筛查及其与毛色关联性分析

？旨在探究狐狸刺豚鼠基因（agouti）多态性及其与狐狸被毛颜色之间的关系。本研究采用pcr和直接测序的方法对中国5个狐种58只狐狸的agouti基因部分序列进行了snps筛查和单倍型分析。结果表明，在已测序的58只狐狸中首次发现6个snps（g.269g>t、g.295c>t、g.325t>g、g.518g>a、g.608c>a和g.846g>a），它们全部存在于内含子2上。狐属的所有个体（25只）在6个位点全部为纯合子基因型，依次为gg、cc、tt、gg、cc和gg型，而北极狐属的所有个体（33只）在这6个位点则均为另一种纯合子基因型，依次为tt、tt、gg、aa、aa和aa型。6个snps形成两种单倍型：单倍型ⅰ（h1：gctgcg）和单倍型ⅱ（h2：ttgaaa），分布频率分别为42.1%和57.9%。单倍型ⅰ（h1）分布于狐属3个狐种的所有受试个体中，单倍型ⅱ（h2）分布于北极狐属两个狐种的所有受试个体中。进一步分析没有发现6个snps及其单倍型与狐狸毛色的明显关联性，但推测它们是区分狐属和北极狐属的重要功能位点和重要单倍型。