猪sp-a基因启动子区的克隆与序列分析

？为了探明猪spa基因的启动子及其转录调控机制，设计6条特异性引物，采用染色体步移、克隆测序以及序列比对分析，从大白猪基因组中扩增出一段长度为1033bp的猪spa基因的上游序列(dq985806)，其gc含量约为55%。经过生物信息学分析，确定了其转录起始位点及活性区域；发现在转录起始位点上游-33bp处存在1个tatabox，另外还发现了gcbox、caatbox、gtbox以及转录起始子；该序列还包含sp1、tf和nfκb等转录因子结合位点以及1个特殊重复序列5′catcactgt3′。上述试验结果表明，所克隆的1033bp的dna序列是大白猪sp-a基因的启动子区序列。