5株水禽细小病毒全基因组序列分析

？利用pcr技术扩增鹅细小病毒(gpv)zj、g3和ljy毒株与番鸭细小病毒(mdpv)dk和dyl毒株全基因组。序列分析结果表明，除ljy毒株非结构基因（ns）编码626个氨基酸外，其余4株ns全长1884bp，编码627个氨基酸；5株的结构基因（vp）全长均为2199bp，编码732个氨基酸。gpv、mdpvns蛋白不同毒株之间相似性分别为95.9%~99.8%和96.8%~99.0%；而gpv与mdpvns蛋白之间相似性为88.9%~90.4%。gpv、mdpvvp蛋白不同毒株之间的相似性分别为90.2%~100.0%和96.9%~99.3%，而gpv与mdpvvp蛋白之间的相似性为79.5%~81.6%，表明gpv抗原性不同于mdpv。mdpv与gpvns蛋白均含有4个潜在的糖基化位点；在结构蛋白区域，mdpvvp含有8个潜在的糖基化位点，而gpv为6个糖基化位点，g3与ljy毒株分别缺失582—584ntt和703—705nrt潜在的糖基化位点。5株水禽细小病毒的进化分析表明，gpv、mdpv在进化上形成两个独立的分支，各个基因片段之间未发生重组。