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牲畜兽医学报 2014
6株t4类噬菌体尾丝蛋白gp37基因密码子特性比较, PP. 1330-1335 Keywords: 噬菌体,gp37基因,密码子偏好性,生物信息学 Abstract: ?利用多种生物信息学软件对本实验室分离的1株t4类多价烈性噬菌体bp7尾丝蛋白gp37基因与其他5株t4类噬菌体gp37基因进行密码子特征的分析比较。结果显示:bp7与其他5株t4类噬菌体gp37基因密码子使用模式基本一致;bp7尾丝蛋白gp37基因密码子偏好性较低,且偏爱使用以a或u为结尾的密码子;除aug(met)和ugg(trp)外,确定了17种高频密码子;6株菌体gp37之间密码子偏好性比较发现,bp7与js98密码子使用最相近,与t4和t4t相对较远;gp37基因密码子的使用模式可能受中性突变和选择压力的共同作用。gp37基因密码子的分析结果将为bp7尾丝蛋白的基因改造,以进一步拓宽其裂解谱及提高表达水平提供理论指导。
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