猪socs3基因的克隆、生物信息分析及热应激条件下的表达

？鉴于细胞因子信号传导抑制因子3（socs3）与多种疫病的发生密切相关，推测其可能在热应激致病中发挥重要作用。本研究克隆了猪socs3基因cdna序列，发现socs3基因开放阅读框（orf）长690bp，编码229个氨基酸的前体蛋白。其与八眉猪、马、牛、人和小鼠的氨基酸序列一致性分别为98.2%、97.4%、96.5%、97.8%和96.4%。该蛋白分子量25.1ku，等电点（pi）8.84，具有socs家族特异的中央sh2区、c末端40个氨基酸的socsbox区及12个氨基酸的kir结构区。荧光定量pcr结果显示，肠系膜淋巴结中socs3mrna在热应激的第3、6和9天显著下调（p≤0.05）。但在胸腺和小肠黏膜中，尽管在第3天呈下降趋势，但在第6和第9天显著上调（p≤0.05）。本研究成功克隆了猪socs3基因，发现其在热应激条件下表达量发生明显改变，并呈组织和时间依赖性。