鸭cd8α基因克隆及不同禽类分子进化分析

？采用rt-pcr和ld-pcr技术克隆了5个鸭种（金定鸭、樱桃谷北京鸭、番鸭、绿头鸭和斑嘴鸭）cd8α基因编码区序列，结合genbank中已有禽类（红色原鸡、北京油鸡、斑胸草雀和火鸡）的cd8α序列，采用jmodeltest最适核苷酸替代模型筛查，使用dambev4.5.2对核苷酸替换(转换/颠换)的饱和性进行检测；并采用最大似然法检测各位点承受的选择压力。测序结果表明，不同鸭种间仅发现少数点突变，其编码区序列相当保守；aic信息量准则检验结果发现9种禽类cd8α基因的最优核苷酸替代模型为“gtr+g”，核苷酸替换的饱和性检测结果表明序列的核苷酸替换并未饱和；应用mega5.0构建了禽类cd8α基因的系统发育关系树，不同禽类cd8α基因大致划分为3类；“位点-特异”模型检测到7个受到正选择作用的位点，其中4个位于功能重要的区域。本研究成功地克隆了鸭cd8α基因编码区序列，并发现不同禽类cd8α基因在分子进化中是保守的，研究结果为进一步了解禽类cd8α基因进化历程、结构与功能变异提供理论依据。